Начало истории храма - 1828, когда 12 июня пала турецкая крепость Анапа. В православии это день святых Онуфрия Великого и Петра Афонского. Храм освящен в 1837, разрушен в 1855. Новое здание храма освящено в 1874. Богослужение возобновилось 1 декабря 1991 г.